Enligt polisen har minst fem människor dött och många har skadats.
Bussen – som hörde till det tyska bussbolaget Flixbus – körde av oklara skäl av vägen och blev liggande på sida.
Motorvägen A9 förbinder Berlin med München.
Över 50 passagerare var ombord på bussen som var på väg från Berlin till Zürich i Schweiz då olyckan inträffade.
Flixbus driver ett nätverk av långväga busstjänster i och utanför Europa.
Källor: Reuters, AFP, AP