Enligt myndigheterna har 28 personer räddats.
Fartyget Sea Story skickade ut en nödsignal tidigt på måndagen. Det hade lämnat hamnen Porto Ghalib på lördagen för en fem dagar lång dykresa. 31 turister och 14 besättningsmedlemmar befann sig ombord.
Hamnen ligger i närheten av Marsa Alam. Havsområdet kring turistorten är ett populärt mål för dykare och har flera kända korallrev.
En av turisterna ombord är från Finland rapporterar flera medier, bland dem BBC. Utrikesministeriet har bekräftat att en finländare är saknad, rapporterar Yle Uutiset.
Räddningsoperation vid vraket pågår fortfarande. Den egyptiska marinen har både fartyg och helikoptrar i området.
Dykfartyget Sea Story rapporteras vara byggt 2022. Det 44 meter långa fartyget kan ta emot 36 passagerare.