Supportrarna försökte också ta ner ytterligare en flagga men stoppades av polisen som följde med supportrarna när de marscherade genom staden på väg till VM-kvalmatchen i Tölö.
Vid Regnbågsalliansen, som arbetar för regnbågspersoners rättigheter och välmående i Finland, säger man att det är en sorglig händelse.
– Jag skulle vilja kunna säga att jag är chockad, men det är jag tyvärr inte. Den spontana reaktionen är att det är sorgligt, men jag är inte förvånad, säger Isabel Flemming, verksamhetsledare för Regnbågsalliansen.
Hon säger att skändande av regnbågsflaggor sker varje sommar, och att det inte är något som kan hanteras lättvindigt, eftersom det handlar om en symbol som representerar en viss grupp människor.
– Jag brukar fundera vad reaktionen skulle vara om det skulle handla om till exempel en finlandssvensk, eller en samisk flagga, eller till exempel en religiös symbol, säger Flemming.
Flemming säger att man noterat en försämring av samtalsklimatet kring regnbågspersoner under de senaste åren också internationellt.
– I Polen har situationen för regnbågspersoners rättigheter tydligt gått bakåt.
I fallet vid Musikhuset grep polisen in i händelsen och stoppade att ytterligare en flagga drogs ner, vilket uppskattas av Flemming.
Hon tycker att myndigheter borde sätta ner foten för att dylika saker inte ska hända igen.
– Myndigheter borde reagera och göra det kraftigt för att visa att det inte är ett skämt. Det handlar om en redan utsatt befolkningsgrupp och att tolerera att man stjäl flaggor och skändar dem, sänder dåliga signaler om regnbågspersoners rättigheter.
Hon säger att privatpersoner också borde hjälpa till.
– Civilkurage är alltid bra och främst från majoritetsbefolkningen behövs det allierade. En minoritet kan inte ensam kämpa för sina rättigheter utan det behövs stöd från andra grupper. Samtidigt måste man förstås tänka på sin egen säkerhet och om det handlar om 30 stycken polska fotbollsfans förstår jag att man kanske som enskild person inte kan ingripa. Men nu fanns det poliser på plats och då var det deras jobb att ingripa, säger Flemming.